霉菌性阴道炎的危害有：
造成不孕
阴道在正常情况下有一个相对安全的环境，菌群比较平衡，酸碱度比较均衡。这种适宜精子暂时存留、通过的环境，是非常重要的，一旦这种环境被破坏，就容易发生不孕。
如果患了霉菌性阴道炎，阴道的酸碱度的改变会使精子的活动力受到抑制，且炎性细胞可吞噬精子，并使精子活动力减弱，白色念珠菌有凝集精子的作用，以及炎症发生时的性交痛和性欲减退等，均可影响怀孕。此种不孕经积极治疗后可很快恢复正常。但霉菌性阴道炎导致的不孕是暂时性的，疾病痊愈后仍可受孕。
影响胎儿发育
孕妇患病后，极少数人阴道中的念珠菌能经宫颈上行，穿透胎膜感染胎儿，引起早产。当胎儿经母亲阴道分娩时，也可能被念珠菌感染，多引起口腔念珠菌病，如通常所说的鹅口疮就是口腔念珠菌感染引起的。有些婴儿还可能出现肛门周围念珠菌性皮炎。由此可见，为了避免感染胎儿，孕妇患霉菌性阴道炎后应积极治疗。
引起其他疾病
若霉菌性阴道炎长期不治疗的话，易造成炎症上行，引起宫颈炎和宫颈糜烂，如果病原体进入宫腔，则会引起输卵管卵巢炎症、盆腔炎等，更后影响怀孕。
影响生活质量
得了霉菌性阴道炎，会伴有外阴瘙痒等症状，对女性的生活和工作会造成诸多的不便和影响，也会影响到夫妻生活。(建议阅读：霉菌性阴道炎治疗方法)
