巢囊囊肿在早期并无明显的临床表现，患者往往因其他疾病就医在行妇科检查时才被发现，以后随着恶性病的生长，患者有所感觉。其症状与体征因恶性病的性质大小、发展有无继发变性或并发症而不同。
1.下腹不适感：为患者未触及下腹肿块前的更初症状。由于恶性病本身的重量以及受肠蠕动及体位变动的影响使恶性病在盆腔内移动牵扯其蒂及骨盆漏斗韧带，以致患者有下腹或骼窝部充胀下坠感。
2.腹围增粗腹内肿物：是主诉中更常有的现象。患者觉察自己的衣服或腰带显得紧小，方才注意到腹部增大，或在晨间偶然感觉因而自己按腹部而发现腹内有肿物，加之腹胀不适。
3.腹痛：如恶性病无并发症，极少疼痛，因此卵巢瘤患者感觉腹痛尤其突然发生者，多系瘤蒂发生扭转，或为恶性病破裂出血或感染所致。此外恶性囊肿多引起腹痛腿痛，疼痛往往使患者以急症就诊。
4.月经紊乱：一般卵巢甚至双侧卵巢囊肿，由于并不破坏所有的正常卵巢组织，故多半不引起月经紊乱。有的子宫出血并不属于内分泌性，或因卵巢瘤使盆腔的血管分布改变引起子宫内膜充血而起;或由于卵巢恶性恶性病直接转移至子宫内膜，所致因内分泌性恶性病所发生的月经紊乱常合并其他分泌影响。
5.压迫症状：巨大的卵巢恶性病可因压迫横膈而引起呼吸困难及心悸，卵巢恶性病合并大量腹水者也可引起。
6.卵巢囊肿阻塞产道：但有的卵巢恶性病患者的呼吸困难系由一侧或双侧胸腔积液所致;并且往往合并腹水形成所谓 Meigs 综合症。查出卵巢恶性病后，建议到正规医院听从专业医生指导治疗。(建议阅读：患有卵巢囊肿有必要通过手术治疗吗)
