1.妊娠子宫
子宫肌瘤并发囊性变时，易误诊为妊娠子宫;而妊娠子宫，特别是40岁以上高龄孕妇，或过期流产而有流血者，也可能误诊为子宫肌瘤。临床上遇见育龄妇女而有停经史者，应首先想到妊娠之可能，经B型超声检查或hCG测定不难确诊，必要时应刮宫加以鉴别。要特别注意肌瘤合并妊娠，此时，子宫较停经月份为大，外形多不规则，质地较硬，B型超声检查可协助确诊。
2.卵巢恶性病
实性卵巢恶性病可能误诊为浆膜下肌瘤;反之，浆膜下肌瘤囊性变也常误诊为卵巢囊肿，当卵巢恶性病与子宫有粘连时鉴别更为困难，可作B型超声检查，有时需在剖腹探查时方能更后确诊。
3.子宫肌腺瘤
临床上也表现为月经量增多及子宫增大，与子宫肌瘤明显不同处在于以痛经为主要症状，也常遇到痛经不明显者而诊断为子宫肌瘤。检查时子宫多呈均匀性增大，且有经期增大而经后缩小的特征。
4.子宫肥大症
此类患者主要临床表现也是月经增多、子宫增大，故易与子宫肌瘤混淆。但本症为子宫均匀增大，且很少超过2个月妊娠子宫，B型超声可协助诊断。
